Министерството за транспорт ги врши работите што се однесуваат на:

•    патниот сообраќај и патната инфрастуктура;
•    железничкиот сообраќај и железничката инфраструктура;
•    воздушниот сообраќај и воздухопловната инфраструктура;
•    внатрешната пловидба;
•    поштенскиот сообраќај и поштенската инфрастуктура;
•    други видови на транспорт и инфраструктура која е неопходна за вршење транспорт (жичари и ски-лифтови и слично);
•    станбено-комуналните работи, соодветната инфраструктура, уредувањето на просторот и управувањето со градежното земјиште во сопственост на Републиката и
•    врши и други работи утврдени со закон.

Во состав на Министерството за транспорт е:
•    Капетанијата на пристаништата.