Министерството за одбрана ги врши работите што се однесуваат на:

•    остварувањето на системот на одбраната на независноста и територијалниот интегритет на Република Македонија;
•    планирањето, организацијата, опремувањето, развојот и подготвувањето на Армијата на Република Македонија и спроведувањето на утврдените планови;
•    организирањето и подготвувањето за одбрана;
•    организирањето и спроведување на обуката за одбрана;
•    надзорот од негова надлежност и
•    врши други работи утврдени со закон.
 

Согласно Законот за одбрана, член 20, Министерството за одбрана подготвува стратегија за одбрана, врши процена на можните воени и други опасности со кои се загрозува суверенитетот, самостојноста и територијалниот интегритет на Републиката, го организира и подготвува системот на одбраната и предлага мерки за негов развој и усовршување.